アジア・アフリカ地域研究研究科は、アジア・アフリカ地域に関する深い理解と国際的・総合的視野をもつ先導的な地域研究者及び地域実務者の養成をめざす。教育プログラムとしては、５年一貫制博士課程を提供し、学生の主体的なフィールドワークの取り組みと指導教員群による研究指導を通して、アジア・アフリカ地域に関する基本的知識及び専門的知識を習得し、地域の実態に根ざした主題の調査・研究によって、高い学術的意義、先進性、創造性などを有する優れた博士論文を完成することを目標とする。
　講義は、専攻科目と研究科共通科目から構成されており、地域研究の基礎的な問題とアプローチの方法やアジア・アフリカ地域に関する広範な専門的知識を習得すると共に、文理融合、地域間比較を含めた総合的地域研究のパースペクティブを養う。課題研究では、学生は各自の研究指導分野に関わる指導教員群との相互討論によって自らの問題意識を明確にし、個別課題に取り組む。また、研究演習においては、学生の創造的発想を促し、自立した研究を進めていけるよう、徹底的な相互討議にもとづく指導をおこなう。研究成果は、他分野、他部局の研究者、一般市民が参加する公開演習で発表し、広く社会に開かれた地域研究の重要性を体得する。
　これらの授業科目の履修及び指導教員群による研究指導に加え、必要に応じて主体的にフィールドワークをおこない、博士予備論文をまとめ、最終的に博士論文を作成する。